为规范收支行为，加强财务管理，提高经济效益，促进卫生院持续发展，根据《会计法》及《医院财务制度》的有关规定，特制订本制度。
一、收入管理
卫生院收入是指卫生院在开展业务及其他活动中依法取得的非偿还性资金，以及从财政及主管部门取得的财政补助经费。包括：财政补助收入、上级补助收入、医疗收入、药品收入、其他收入。
(一)实行收入预算管理
单位应根据上年度实际收入水平，结合当年的业务计划及医疗收费标准调整情况来确定收入总额。
为了促进收入预算顺利实现，单位应每季开展预算执行情况分析，考核、评价收入预算的执行情况，分析完成好坏的原因，发现薄弱环节和问题，提出改进措施和意见，保证全年总收入预算的顺利完成，并为编制和执行下年度预算提供依据。
(二)严格执行国家规定的收费标准和加强收费票据的管理
乡镇卫生院的各项收费要认真执行国家的物价政策，做到“应收则收，应收不漏”，但任何部门和个人不得发生巧立名目、分解项目、重复收费等乱收费行为。单位应根据实际情况配设专职(或兼职)物价员，及时检查和收集收费情况，保证收入的合法性、完整性。
收费票据分为财政部门统一监制的票据和自制票据。乡镇卫生院的门诊、住院等收费必须使用财政部门统一监制的收费票据;单位内部管理需要可使用自制或外购收款票据。所有收费票据和自制收款票据须由单位财务部门统一管理，由专人负责，实行领用核销制度。不得出借、出让收费票据，行政事业性收款收据不得用于经营性收费。
(三)单位的全部收入纳入财务部门统一核算和管理。
卫生院的收费部门主要由财务科、挂号室、门诊收费处和住院结算处组成，开展的业务收费由挂号室、门诊收费处、住院收费处负责，其他各种收费由财务科统一办理，其他任何部门和个人都不得向病人或单位直接收取任何费用。
挂号、门诊及住院收费处应将每日收到的现金及支票于当天存入银行，或及时上交出纳人员，同时编制“收费日报表”，并将“收费日报表”及附件(收支票据存根联等)送交财务部门，出纳应根据收入凭证及时入账，并在凭证上加盖“现金收讫”章。
严禁业务科室截留收入，严禁私设小金库。卫生院也不得将收入转到三产、工会、食堂等部门。
(四)加强对医院收入的控制
卫生院应设专职或兼职稽核、审计人员，加强对各收费部门报来的收入凭证和存根的审核，如是否少收或多收、日报表金额是否与所附存根金额合计数一致、是否足额交库等;药品收入应注意是否与药房处方合计数一致;是否严格使用财政部门统一监制的收费票据，有无使用其他票据而使资金出现外流等现象。
(五)为合理扩大卫生院业务收入寻找途径
业务收入是卫生院补偿消耗的主要手段，卫生院要增加业务收入，除了按收费标准规定收费外，还要充分挖掘单位内部潜力，利用现有设备和技术条件，扩大医疗服务项目，提高单位的社会效益和经济效益。
卫生院应根据实际开展每季度业务收入完成情况的分析。根据收集的财务信息，从医疗业务工作量和收费水平二个因素影响着手，结合全年各个时期收入进度、水平，通过与预算对比，与上年同期实际对比，与同行业先进水平对比，查找差距原因，预测发展趋势，为改进工作和决策提供依据。
二、支出管理
卫生院的支出是指在开展业务及其他活动发生中的资金耗费，包括医疗支出、药品支出、其他支出、财政专项补助支出。卫生院的各项支出必须贯彻“厉行节约，勤俭办事业”的原则，执行国家有关方针、政策，遵守有关财务制度和财经纪律。
(一)预算管理
支出预算的编制应本着既要保证医疗业务正常运行，又要合理节约的精神，以计划年度事业发展计划、工作任务、人员情况、开支定额和标准、物价因素等为基本依据。
卫生院要加强对支出预算的控制。为了确保预算的顺利完成，根据卫生规模可将预算分解成部门预算，并加强对各项支出的事前和事中控制，每季对支出预算执行情况进行分析，运用一定的方法考核分析各因素对支出完成的影响程度，抓住关键问题，研究对策，降低成本，促进工作。
卫生院要严格遵守国家规定的成本开支范围，正确划分费用支出(正常业务开支与资本性支出)的界限，不属成本范围的支出不应计入成本。
(二)专项资金支出管理
专项资金包括财政部门和主管部门拨入的专项资金和医院内部形成的有专门用途的资金。卫生院对专项资金支出，要根据量入为出、专款专用的原则。
凡是大型设备购置、大型修缮及基建等项目，须经卫生院有关人员共同作社会效益、经济效益二方面的可行性论证和效益评估，并按有关规定程序报批，办理相关手续;各投资项目须严格按国家有关规定、合同及项目进度支付款项，大型基建项目须在竣工半年内办理决算手续。卫生院应开展投资项目效益分析，及时发现问题，改进经营管理、挖掘潜力、提高投入资金的使用效益。
从财政部门或主管部门取得有指定用途的专项资金应当登记备查簿，并按要求向主管部门报送专项资金使用情况的有关资料，接受财政、审计及主管部门的检查验收。
卫生院要加强对职工福利基金的管理。职工福利基金主要用于职工救济、集体福利设施支出、单位职工食堂的补助及国家规定可由职工福利基金开支的其他支出等，要有计划安排列支和对支出进行决算，并要充分发扬民主，接受群众监督。
(三)严格控制支出，提高资金使用率
卫生院应制定资金收支审批制度，并严格按审批程序办理审批手续。建立健全各项支出管理制度，对差旅费、交通费、业务培训费、其他费用等与经营无直接关系的消耗支出，应严加控制，尤其是招待费，应严格按照《浙江省〈医院财务制度〉补充规定》要求进行控制列支。资金的使用要在注重社会效益的同时，讲究经济效益，做到少投入，多产出。
卫生院发给职工的各种奖金及加班工资，应按上级有关文件执行，其奖金总额不超过本单位国家规定工资(即职务工资、事业津贴、岗位津贴)的额度内。个人消费基金增长率不得超过业务增长率，以防止个人消费资金过快增长。卫生院可实行绩效工资制，以防止亏损现象发生。
卫生院应建立每季成本费用和财务效益的分析制度，及时了解各项支出增减及结构变化情况，尤其是对在总支出中占有较大比例和一些纯消耗性的项目要作重点分析，运用比较分析法、差额分析法、指标分解法、连环替代法、定基替代法等方法，查找变化原因，适时提出改进工作的建议和措施，为进行财务决策提供准确、科学的信息。